革蘭氏陰性菌選擇培養基是用來將某種或某類微生物從混雜的微生物群體中分離出來的培養基。根據不同種類微生物的特殊營養需求或對某種化學物質的敏感性不同，在培養基中加入相應的特殊營養物質或化學物質，抑制不需要的微生物的生長，有利于所需微生物的生長。

　　一種類型選擇培養基是依據某些微生物的特殊營養需求設計的，例如，利用以纖維素或石蠟油作為碳源的選擇培養基，可以從混雜的微生物群體中分離出能分解纖維素或石蠟油的微生物；利用以蛋白質作為氮源的選擇培養基，可以分離產胞外蛋白酶的微生物；缺乏氮源的選擇培養基可用來分離固氮微生物。另一類選擇培養基是在培養基中加入某種化學物質，這種化學物質沒有營養作用，對所需分離的微生物無害，但可以抑制或殺死其他微生物，例如，在培養基中加入數滴10%酚可以抑制細菌和霉菌的生長。

　　乳腺炎革蘭氏陰性菌顯色培養基（Salmomnella typhi）可以在這種培養基上生長；在培養基中加入染料亮綠（brilliant green）或結晶紫（crystal violet），可以抑制革蘭氏陽性細菌的生長，從而達到分離革蘭氏陰性細菌的目的；在培養基中加人青霉素、四環素或鏈霉素，可以抑制細菌和放線菌生長，而將酵母菌和霉菌分離出來。現代基因克隆技術中也常用選擇培養基，在篩選含有重組質粒的基因工程菌株過程中，利用質粒上具有的對某種（些）抗生素的抗性選擇標記，在培養基中加入相應抗生素，就能比較方便地淘汰非重組菌株，以減少篩選目標菌株的工作量。